此处罗列着所有Site-132的部门，包括普通部门与特殊职能部门。
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管理层（Administrators）
“全知的眼啊，请指明我们的方向。” - Dr.Francisco Kauss Williams
顾名思义，管理层即各部门最高职能者统一规划，并与设施总监共议各项事件的一个部门/层级。
管理层握有直接启动Delta核弹及紧急预案的权力，该权力可绕过任何存在或不存在的限制，并且不可随意剥夺。
管理层人员：
Dr.Francisco Kauss Williams（设施总监 - Facility Manager）
Dr.Dom Norris（研究主管 - Research Manager）
Dr.Gabriel Crawford（研究主管 - Research Manager）
曹国盛 博士（安全主管 - Security Chief）
Dr.Charles Winston（人事部主任 - Humanity Resources Administer）
Quasimodo.AIC
科研部（Researching Department）
“以吾等之身，燃起星火。” - Dr.Gabriel Crawford
部长：Dr.Dom Norris
与其他普通部门一样，你只需要知道它们的名字就可以推理出职能。科研部负责所有的项目研究，是理论体系的一把手。无论是站点设计、收容单元、收容措施构想，或者特遣队的装备，科研部都立下了汗马功劳。
因此，科研部是员工薪水最小值最高的的部门之一。能在这里做员工的都不是什么普通人。
工程部（Engineering Department）
“再他妈往施工队的建材里乱塞东西，我就睡了你的老婆！” - Dr.Esteban Wilde（当然，他并没有这么做）
部长：Dr.Esteban Wilde
工程部负责站点的建造、安防系统的布置，甚至包括能量供给系统的布置，业务覆盖范围极广，以至于高温补贴的“高温标准”为38℃以上，并且站点内所有温度测量系统不得出现超0.1℃的测得值偏差，量程至少为-10℃~45℃，并且必须以正常量程运转。
人狠话不多是他们最大的特点，他们从不谈闲天，因为实践才是检验真理的第一标准。
人事部（Humanity Resources Department）
“你们不是铁壁中的一颗螺丝钉，或是一块钢板，你们是铁壁的设计师与建造者。” - Dr.Francisco Kauss Williams
部长：Dr.Charles Winston
人事部也贯彻“实践是检验真理的第一标准”原则，腐败体系最严厉的父亲之一，多数时候发生的裁员就叫裁员，还会附赠被裁员者“记忆消除+离职补贴”大礼包一份。在不定时（上限1.5月）的调查中，裁掉腐败分子，以清廉者代其位的行为名叫优化。
此外，最好不要去自以为是地给现行的人员审核制度提意见，设施成立初期的人事部就已经因为这个问题导致员工死亡率飙升了。——因为他们较真。
武装部（Equipment Department）
“天之圣光，焚尽孽海。” - Daniel Northland指挥官
部长：Vice Stanley指挥官
武装部可以调用所有安防设备、贮存于武器库的所有武器，以及试验中的SBR，或者各种各样能够对异常造成杀伤的武器。
并且，武装部可以调用Kappa-Vex型高爆弹头，该型号弹头足以对诸如坦克一类的大型武装单位造成有效且强大的杀伤。
惑心部（Confusing Department）
“播撒谎言之种，筑起谜题之墙。” - Dr.Rick Insanity
部长：Dr.Rick Insanity
惑心部，俗称信息危害处理部，是专职对信息危害进行处理的部门，在这里任职的人或多或少都有点毛病，但正是这种毛病使得他们来到了这个部门。它也是员工薪资最小值最高的部门，但代价是周末还有4~6小时的工作时间。
障心部（Mind-Killing Department）
“执障心之刃，断世间妖言。” - Dr.Mark Hudson
部长：Dr.Mark Hudson
障心部，俗称认知危害处理部，是专职对认知危害进行处理的部门，其强大之处在于所掌握的认知阻抗技术与反向破解的认知危害武器。
纵火部（Arson Department）
“愿以此生燃燎原之火。” - Dr.Mark Hudson
部长：待定
纵火部是与遏火部职能相反的部门，旨在让员工自发留在基金会，并不对执意离开基金会者作过多的、代价过大的挽留。
纵火部的推波助澜通常被认为是MTF-NO-Phi-10 “分裂死士”诞生的主要原因之一。
繁衍与存续部（Reproduction 'N Survival Department）
“生息未断，则子子孙孙无穷匮也。” - Alexa Konq研究员
部长：待定
繁衍与存续部，简称繁存部，是Site-132耗资最大的特殊职能部门，孟德尔以豌豆作为其遗传学实验对象，繁存部的实验对象为白鼠等与人类存在一定基因相似度的生物。
并且，繁存部的贡献主要集中于医疗，在器官移植方面，其成功地让移植器官与原体不产生排斥，并且原理并非遏制原体对外来物的排异反应。
他们是人类最肮脏但最强大与上进的先驱，踏着前人破碎的尸体前行，因此大多数文章与实验中含有成人性质的内容。切忌向Konq研究员询问任何有关该部门的信息。惑心部不会放过你的。
金与权部（Finance 'N Authority Department）
“金、权、世间，皆入我手。” - Dr.Esteban Wilde
部长：待定
金与权部由被解散的财政部重组而来，是管理层之下权力最大的部门，是官僚主义最大的敌人，虽没有多少人情，但员工待遇已经让同行称金与权部职员为“走社派”。